Wykonuje skok do innego miejsca w programie, przy czym na stos zostaje położony adres powrotny wskazujący na miejsce obok miejsca w pamięci, w którym wykonano rozkaz JSR.

Za pomocą tego rozkazu można zasymulować podprogram, lub w językach wysokiego poziomu procedurę lub funkcję. Można napisać kod asemblerowy do wielokrotnego wykorzystania, do którego można skoczyć i z niego wrócić do punktu pierwotnego po wykonaniu.

Aby powrócić z podprogramu, należy wywołać rozkaz RTS. Należy się upewnić, czy na stosie znajduje się właściwy adres powrotny, gdyż ten rozkaz jest "bezkrytyczny".

Opkod	Tryb adresowania	Czas wykonywania (cykle)
$20	Bezwzględny	6